Bischof Dr. Paul-Werner Scheele weihte ihn am 20. Oktober 1991 im Würzburger Kiliansdom zum Ständigen Diakon. Im Anschluss wirkte Fischer als Diakon mit Zivilberuf in den Aschaffenburger Pfarreien Sankt Kilian und Sankt Laurentius. Ab 2002 war er in Aschaffenburg-Sankt Laurentius eingesetzt, von 2006 bis 2007 in Goldbach-Sankt Nikolaus. Auf eigenen Wunsch wurde Fischer 2007 entpflichtet, engagierte sich aber weiterhin ehrenamtlich in der Seelsorge in seinem Wohnort Aschaffenburg und Umgebung. Fischer ist verheiratet und Vater eines erwachsenen Kinds.
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